提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
(文图:赵筱尘 巫邓炎)
[责编:天天中]
阅读剩余全文()
推荐阅读
彩神注册詹韦瓜齐聚观战布朗尼比赛 年轻皇帝遇高手
2024-02-22
彩神注册贾静雯与仨女儿合照有爱
2024-04-26
彩神注册心态崩了?阿德抢七大战迷失自我 正负值全场最低
2023-12-18
彩神注册美阿帕奇直升机服役33年仍居榜首 中国武直差在哪
2023-11-02
彩神注册曼联切尔西史诗级菜鸡互啄!两边看了都想骂人
2024-06-02
彩神注册享受退休生活 诺天王与妻子在墨西哥海边度假
2023-10-16
彩神注册马斯克:特斯拉下一代跑车续航超1000公里
2024-01-05
彩神注册VR帮助人们记录历史地标
2024-04-24
彩神注册三缸没什么不好 试驾东风雪铁龙云逸1.2T
2024-02-02
彩神注册蔡徐坤,凭啥圈这么多的粉
2023-11-29
彩神注册韩国瑜公布“收到捐赠1.29亿” 要求蔡正元道歉
2024-04-12
彩神注册中国品牌拿下印度手机市场66%份额 自拍相机受欢迎
2024-01-27
彩神注册带上望远镜,去这些地方“偷窥”鸟儿谈恋爱
2024-03-18
彩神注册杜伽Taurus K320银轴白光版机械键盘评测
2023-10-11
彩神注册陕西省委原秘书长被双开:拒绝接受党组织挽救
2024-04-09
彩神注册苏州高新:立足高新,转型升级,经营绩效持续实现新突破
2023-11-06
彩神注册无印良品为穷人造房子 带全屋家具每套仅100多万
2023-11-25
彩神注册女子怀疑男友出轨 在其内裤蹭辣椒酱泄愤
2024-06-22
彩神注册私募持股曝光:高毅新进8股 淡水泉新进中材科技
2024-03-19
彩神注册Axure8.0产品经理(全集)
2024-04-18
彩神注册 5月苦尽甘来,财源滚滚,日子富贵如意的3大星座
2023-08-27
彩神注册乐清男孩失联案母亲被判1年3个月 这细节令人心疼
2024-01-16
彩神注册[访谈]慕容拖鞋:拒绝无目的
2023-09-29
加载更多 彩神注册地图